DNA-Sequenz-Alignment
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Multiples DNA-Sequenz-Alignment
Ein multiples DNA-Sequenz-Alignment ist die Anordnung zahlreicher DNA-Sequenzen unter Einführung bestimmter Lücken, so dass ähnliche Basen neben- bzw. untereinander gestellt werden. Dabei werden Sequenzidentitäten mit einer positiven Note belegt und entsprechend farblich hervorgehoben, Sequenzunterschiede negativ bewertet und ebenfalls farblich markiert. Eingeführte Lücken werden mit Strafpunkten belegt.
Multalin entwirft ein multiples DNA-Sequenz-Alignment von einer Gruppe verwandter Sequenzen unter Anwendung progressiver, paarweiser Alignments. Die angewandte Methode und die zugrunde liegenden Algorithmen sind beschrieben in "Multiple sequence alignment with hierarchical clustering", F.Corpet, 1988, Nucl. Acids Res. 16 10881-10890.
Last modified 2005-02-10 01:08